臨床上治療腹瀉的藥物很多，有專門用於止瀉的功能性止瀉藥，亦有根據病因選用的抗菌藥、抗病毒藥，以及各種腸粘膜保護劑、微生态調節劑等。上述藥物在治療腹瀉中雖然療效較好，但其中有些藥物對於機體發育尚不健全的小兒來說則不宜。鑒於小兒腹瀉是兒科常見病、多發病，爲人父母者又習慣自行給藥，因此有必要講述一下小兒腹瀉不宜選用的藥物
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    　　易蒙停适用於各種病引起的急慢性腹瀉的治療。但其作用強烈，用於低齡兒童易緻藥物不良反應，如影響中樞神經系統等，加之曾有新生兒用藥緻死的報道，故國内外均限制用於低齡兒，如我國易蒙停使用說明書中就規定5歲以下兒童禁用。
    　　複方苯乙哌啶适用於急慢性功能腹瀉及慢性腸炎的治療。該藥每片含鹽酸地分諾酯2.5毫克、硫酸阿托品0.025毫克，其中地芬諾酯對腸道作用類似嗎啡，可直接作用於腸道平滑肌，作用亦很強烈。由於國内外不斷有應用該藥緻小兒中毒甚至緻死的報道(死亡病例集中於小於兩歲嬰幼兒)，又因該藥小兒用藥劑量至今尚無統一标準，因此兩歲以下嬰幼兒禁用，兩歲以上小兒若用亦須慎之，要嚴格控制用藥劑量。
    　　氟哌酸緻病性大腸杆菌、沙門氏菌屬等所緻的胃腸炎、菌痢有良好療效，臨床應用廣泛，爲人們熟知。但因該藥及其同類(喳諾酮類)藥物有引起骨病變的可能，因此，16歲以下小兒不宜選用。
    　　四環素具有廣譜抗菌作用，治療感染性腹瀉具有一定療效。但8歲以下小兒應用四環素及同類藥物如土黴素、強力黴素、美滿黴素等可緻恒牙黃染、牙釉質發育不良和骨生長抑制，因此8歲以下的小兒應避免應用此類藥物。
    　　藥用炭能吸附導緻腹瀉及腹部不适的多種有毒與無毒刺激物，減輕對腸壁的刺激，減少蠕動，從而起到止瀉作用。但由於該藥吸附作用強且無選擇性，對消化酶如胃蛋白酶、胰酶的活性均有影響，長期應用可緻小兒營養不良，故3歲以下小兒腹瀉或腹脹，禁止長期應用。